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深渊团队与合作者在科学子刊发文揭示微生物群落动态代谢过程

正式发布日期英文:2022-11-15 责任状编写:蔡霞本条信息已被查看了 10 次设置

近日,美国科学杂志旗下权威学术期刊Science Advances在线刊登了海洋科学华体会 吴伟超研究员及其🐼合作者关于土壤微生物群落原位代谢和碳利用效率多样性的研究论文《In Situ Diversity of Metabolism and Carbon Use Efficiency among SoilBacteria》。

对微生物代谢组学的研究表明:在复杂环境下,微生物群落的代谢方式和碳利用效率应当呈现多样化特征,且微生物的表型特征(真实代谢过程)容易受环境因素的影响。然而由于缺少原位代谢途径适用的研究方法,复杂环境中微生物群落(甚至个体间)的原位代谢途径一直是该领域的瓶颈。微生物代谢流是一种广泛应用于代谢工程、人类疾病诊断、药物开发等领域的技术。通过评估微生物代谢网络上的代谢流/碳通量,旨在提高对微生物胞内动态代谢过程的理解,从而进一步理解微生物环境表型特征。吴伟超研究员在2020年开发了基于经典生物地球化学信息指标——磷脂脂肪酸(PLFA)的微生物代谢流评估模型,为实现微生物群落组间甚至个体的代谢流评估提供了新的研究思路,成果发表在自然指数期刊Geochimica et Cosmochimica Acta(Wu etal., 2020)。

为进一个步骤扩张该策略到实际普遍存在的场景样品英文,吴伟超与源于华烨哥廷根上院校、华烨图灵根上院校、芬兰北亚利桑那上院校和中科院深入分析所长沙作物所的深入分析员工做好联合,深入分析了周围自然自然环境场景中细菌学群落的排泄流作为了击破性得知:出具了测试数据的证据来苹果支持场景细菌学群落内部结构各样化的排泄行业,指的私信的是周围自然自然环境细菌学群落组间在排泄流机制上普遍存在显然一定的差异;在群落横向上,细菌学以戊糖磷酸行业(PP)遵循采用红葡萄糖粉,这与近年来来说纯种细菌学和染色体组学的实地调查产生不相符——细菌学以糖酵解行业(EMP)遵循。小论文推断会是而是PP一种关键的抹除性辅酶II(NADPH)的行业,较增强的PP能助细菌学不适应大陆的氧化物场景;这一种各样化的排泄流形式必将产生了细菌学各样化的碳采用转化率,来说认识细菌学的固碳形式有关键的专业指导有何意义。

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(供稿:海洋科学华体会 )

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